规模养殖或将“与粮争地”
人多地少是中国的基本国情，若当前将中国出栏的生猪全部按规模化养殖进行推算，建造近6亿头生猪的标准圈舍需要3万个猪场，其占地需要24万～30万hm2，因猪场防疫的特殊需要和防止对周围环境污染，按照平均距离居民区2km 为半径计算，所需建设用地面积为3800万hm2。
正是如此，规模化养殖面临不足的土地使用面积，势必会占用耕地，引起“与粮争地”的势头。
面临政策风险
生猪养殖行业相对于其他行业而言，免征税收，对地方政府没有财政贡献;由于进行生猪规模化养殖后，养殖场内生猪数量巨大，若发生食品安全问题和大规模疫病流行，会引起整个地区生猪产业链供给发生中断，导致生猪产品的供应瘫痪。
在促进生猪规模化养殖进程中，国家会采取一些相关政策，如发放养猪业财政补贴，而资金需要地方和中央财政按比例分担，当国家财政收入不高时，相应的补贴也会下降。
另外，生猪规模化养殖会产生一系列废弃物，若处理不当，就会造成废弃物污染等。
遭遇人才瓶颈
生猪规模化养殖需要有能力、懂技术、肯吃苦的熟练饲养人员和职业化的场长担任相应工作。但是由于环境恶劣，防疫隔离时间较长，每天工作重复枯燥乏味，使人员流失严重，导致养殖场正常运行受阻。
防疫压力大
行业集中度的提升会使生猪的养殖规模扩大，若防疫技术水平跟不上规模化养殖的需求，就会有可能暴发大规模传染性疾病。据官方数据显示，过去每7年暴发一次大规模传染性疾病，现在出现的频率为每年一次。以口蹄疫为代表的人畜共患传染病经常威胁中国生猪养殖业，进而使动物安全、食品安全和人类健康都受到威胁。
如果不能做好生猪养殖的防疫工作，不但关系到养殖主体收入和市场供应，同时也影响了中国生猪规模化进程。
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